ImageJ软件下载-ImageJ(图像分析软件)v1.53t 官方版下载

软件介绍

　　ImageJ提供绘图和图像编辑功能，可以直接在软件上使用绘图工具创建新的图像，也可以对图像调整颜色，设置锐化参数，设置对比度，添加降噪，也可以减去图像背景，各种操作都直接在主程序菜单上找到相关的工具，并且会显示详细的文字说明，让用户在处理图像的时候获得更多帮助，这款软件功能界面都是比较简单的，基础的图像工具，图像分析工具使用都非常简单，无论是编辑图像还是增强图像都可以在ImageJ软件找到适合的工具，需要就下载吧！

软件功能

　　1、选择：

　　创建矩形、椭圆形或不规则区域选择。创建线和点选择。编辑选择并使用魔杖工具自动创建它们。绘制、填充、清除、过滤或测量选择。保存选择并将其传输到其他图像。

　　2、图像增强：

　　支持 8 位灰度和 RGB 彩色图像的平滑、锐化、边缘检测、中值滤波和阈值处理。交互式调整 8、16 和 32 位图像的亮度和对比度。

　　3、几何运算：

　　裁剪、缩放、调整大小和旋转。垂直或水平翻转。

　　4、分析：

　　测量所选区域或整个图像的面积、平均值、标准差、最小值和最大值。测量长度和角度。使用现实世界的测量单位，例如毫米。使用密度标准进行校准。生成直方图和剖面图。

　　5、编辑：

　　剪切、复制或粘贴图像或选区。使用 AND、OR、XOR 或“混合”模式进行粘贴。向图像添加文本、箭头、矩形、椭圆形或多边形。

　　6、颜色处理：

　　将 32 位彩色图像拆分为 RGB 或 HSV 分量。将 8 位组件合并为彩色图像。将 RGB 图像转换为 8位索引颜色。将伪调色板应用于灰度图像。

　　7、堆栈：

　　在单个窗口中显示相关图像的“堆栈”。使用单个命令处理整个堆栈。以堆栈形式打开图像文件夹。将堆栈另存为多图像 TIFF 文件。

软件特色

　　1、到处运行：

　　ImageJ 是用 Java 编写的，这使得它可以在 Linux、Mac OS X 和 Windows 上以 32 位和 64 位模式运行。

　　2、开源：

　　ImageJ 及其 Java 源代码可免费获取并属于公共领域。无需许可证。

　　3、用户社区：

　　ImageJ 拥有庞大且知识渊博的全球用户社区。超过 1700 名用户和开发人员订阅了 ImageJ 邮件列表。

　　4、宏：

　　使用宏自动执行任务并创建自定义工具。使用命令记录器生成宏代码并使用宏调试器对其进行调试。 ImageJ 网站上提供了300 多个宏。

　　5、插件：

　　通过使用 ImageJ 的内置文本编辑器和 Java 编译器开发插件来扩展 ImageJ。超过 500 个插件可供使用。

　　6、工具包：

　　使用 ImageJ 作为图像处理工具包（类库）来开发 applet、servlet或应用程序。

　　7、速度：

　　ImageJ 是世界上最快的纯 Java 图像处理程序。它可以在 0.1 秒内过滤 2048x2048 图像 ( * )。那就是每秒 4000万像素！

　　8、数据类型：

　　8 位灰度或索引颜色、16 位无符号整数、32 位浮点和 RGB 颜色。

　　9、文件格式：

　　打开所有支持的数据类型并将其保存为 TIFF（未压缩）或原始数据。打开并保存 GIF、JPEG、BMP、PNG、PGM、FITS 和 ASCII。打开DICOM。使用 URL 打开 TIFF、GIF、JPEG、DICOM 和原始数据。使用插件打开和保存许多其他格式。

　　10、图片显示：

　　提供了用于缩放（1:32 至 32:1）和滚动图像的工具。所有分析和处理功能都可以在任何放大倍数下工作。

使用方法

　　斑点印迹分析

　　ImageJ 中有两种用于分析斑点印迹的内置方法。第一种是将每一行视为水平“泳道”，并使用 ImageJ的凝胶分析功能。第二种是减去背景并测量每个点的综合密度。

　　图 1.原始斑点印迹。

　　此点印迹图像可在ImageJ 1.33 或更高版本的“ 文件/打开样本”菜单中找到。

　　图 2.剖面图。

　　这就是当您将斑点印迹中的每一行视为水平“泳道”并使用 ImageJ手册中的凝胶分析程序时得到的结果。每个峰上的数字是相应点的大小占所有点总大小的百分比。启用“分析/凝胶/凝胶分析仪选项”对话框中的“反转峰”以避免出现颠倒的峰。

　　图 3.第一行的剖面图。

　　在第二种方法中，您可以通过绘制每个点的轮廓并使用“分析/测量” 命令来测量每个点的集成密度。此方法通常需要对图像进行背景校正，这可以使用“处理/减去背景”命令来完成。图 3 包含使用“减去背景” 命令并将滚球半径设置为 25 像素进行背景校正之前和之后第一行点的轮廓图（分析/绘制轮廓）。

　　图 4.圆形选择和集成密度测量。

　　校正背景后，在“分析/设置测量”中启用“综合密度” ，创建一个圆形选区，将其拖动到第一个点上，按“m”（分析/测量），然后对其他 27个点重复此操作。注意到图像现在有黑色背景了吗？它被反转（编辑/反转），因此背景像素值接近零，这是正确计算积分密度所必需的。您可以反转查找表（Image/LookupTables/Invert LUT）以恢复图像的原始外观。编辑/选项/图像中的“使用反转查找表”选项将反转像素数据并反转查找表。

　　图 5.使用图 (A) 和积分密度 (B) 得到的结果。

　　此电子表格中的第一列包含使用rsb.info.nih.gov/ij/docs/menus/analyze.html#gels 上的凝胶分析程序测量的28 个点的积分密度（占总数的百分比）。第二个包含通过使用 “处理/减去背景”进行背景校正、在“分析/设置测量”中选择“积分密度” ，然后使用圆形选择测量28 个点中的每一个而获得的结果。

　　您还可以使用 Bob Dougherty 的 MicroArray Profile 插件以及 Gilles Carpentier 的ImageJ点印迹分析仪工具集来分析点印迹和微阵列，这些工具集可在 ImageJ 网站的 Macros/toolsets 文件夹中找到，并记录在image.bio.methods.free.fr /dotblot.html

　　FFT 滤波

　　这是您可以使用 fft 过滤的妙用之一。激光扫描共焦显微镜沿 X 轴扫描。如果激光器中存在噪声，那么这在相邻的 X 轴扫描中表现得最为明显。过滤交替X 轴强度的频率可以清理图像。

　　Gilles Carpentier 从该合成图像中提取了原始 256x256 图像，并尝试重现结果。他还提供了几个用于消除水平条纹的宏。

　　图像处理工具包也在 photoshop 中执行此操作。

　　示例由阿尔伯特·爱因斯坦医学院分析成像设施的 Michael Cammer 提供。

　　测量 DNA 轮廓长度

　　这是如何测量使用原子力显微镜 (AFM) 获取的图像上 DNA 轮廓长度的示例。它需要 ImageJ 1.30 或更高版本。

　　图 1.沉积在云母上的 538 bp DNA 片段的 AFM 图像。

　　在此示例中，我们测量右下角 DNA 轮廓的长度。图像的视场宽度为500nm。该图像来自 M. Lysetska 等人，“UV 光损伤的 DNA及其与人类复制蛋白 A 的相互作用：原子力显微镜研究”，Nucleic Acids Research，2002 年，第 1 卷。30，第 12 号2686-2691 (nar.oupjournals.org/cgi/content/full/30/12/2686 )，经许可使用。